Музей-заповедник «Фанагория» был создан в 2014 году. В его основу легла экспозиция уникальных археологических находок, происходящих из античной Фанагории и ее округи, организация непрерывного научного изучения археологического памятника, сохранение историко-культурного наследия и естественного природного ландшафта Фанагории.
Сегодня Фанагория — один из важнейших в России археологических памятников античной эпохи федерального значения. Для туристов разработаны экскурсионные туры по археологическому памятнику «Фанагория» продолжительностью от 45 до 90 минут, где гости могут ознакомится с границами городища и его окрестностями, посетить раскопы «Верхний город» (исследуются древнейшие слои города, относящиеся к VI-V вв. до н.э.), «Нижний город» (демонстрация исследуемого квартала города с инфраструктурой и предметами быты: дома, водостоки, жернова и т.д.) и посетить интерактивные площадки.
Музей-заповедник «Фанагория» расположен вблизи к подъездным путям Крымского моста; автомобильных дорог регионального и федерального значения; международного аэропорта и железнодорожного вокзала г. Анапы, что делает доступным шедевры античного культурного наследия для широкого круга туристов и отдыхающих Черноморского побережья России, а также туристов, отправляющихся на отдых в Республику Крым.
